Paragominas foi fundada pelo mineiro Célio Rezende Miranda, com a colaboração dos goianos Eliel Pereira Faustino e Manoel Lima, que chegaram ao local no ano de 1959. O município nasceu em função da rodovia Belém-Brasília. Foi desmembrada dos municípios de São Domingos do Capim e Viseu, emancipando-se no dia 23 de janeiro de 1965.

A extração de madeira, sua industrialização e venda era a responsável por 60% da economia do município. Isso mudou com a operação Arco de Fogo, que fechou serraria clandestinas na cidade que desmataram 81km² no período analisado pelo site Amazônia.org.br (maio de 2007 a maio deste ano). Com isso, a expectativa da prefeitura local é que o município desenvolva a agricultura e mais ainda, a agroindústria, muito embora, ainda continue sendo a madeira sua maior fonte de renda, mesmo que ilegal.

Suas terras são propícias à agricultura, produzindo arroz, milho, feijão, mandioca, pimenta-do-reino, urucum, seringueiras, soja, algodão, café, hortaliças em geral e frutas tropicais. A cidade vem recebendo novamente uma significativa quantidade de imigrantes de outras regiões brasileiras impulsionados pela presença da Companhia Vale do Rio Doce (CVRD), que está investindo na extração de bauxita.