Dos 141 municípios existentes no estado, pelo menos 19 foram alvo de embates por questões sociais e, principalmente, ambientais (veja lista abaixo). Todos eles estão na lista dos que mais desmataram a Amazônia nos últimos meses. O destaque, entre os municípios, vai para Nova Ubiratã, líder em desmatamento de maio de 2007 a maio deste ano totalizando 444,9km² de área desmatada.
A educação também é outro desafio para estas cidades matrogrossenses. Segundo o Ideb, nenhum dos municípios atingiu sequer a média (5), sendo que Lucas do Rio Verde levou nota mais alta, com 4,8. A economia dos municípios é basicamente agrária (soja, cana-de-açúcar, milho, açúcar, algodão e pecuária). Entre as cidades, o que possui maior Produto Interno Bruto (PIB) é Cuiabá, com R$ 6,6 bi e a que tem o menor é Nova Bandeirantes, com R$ 54 mi.
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